포케스페×가면라이더 위자드×울트라맨 긴가×마법소녀 리리컬 나노하 (희망×인연)

포케스페 칸토지방에서 로켓단 사건이 끝나고 어느새 가을이 찾아왔다. 마사라타운의 포켓몬 도감 소유자 레드는 포켓몬 리그에서 우승하고 여러 트레이너들과 배틀을 하면서 자신의 포켓몬들의 레벨을 올리는 목표를 갖고 계속 여행을 하고 있었다. 그런데 어느 날 제97관리외세계(마법소녀 리리컬 나노하 세계)에서 쥬얼시드 때문에 일어나고 있는 차원진 때문에 포케스페의 세계에까지 영향이 미치고 있었는데 레드는 여행하는 도중 레드한테 가면라이더 위자드 전용 키 블레이드가 소환되었고 레드는 여행하는 도중에 하얀 마법사(가면라이더 와이즈맨)를 만나 그에게 지금 일어나고 있는 이 지진은 쥬얼시드라는 보석 때문에 일어나고 있는 차원진이라는 것을 듣고 이 사건을 막고 싶은 생각은 있냐고 묻자 레드는 그렇게 하고 싶다고 대답하자 하얀 마법사가 레드한테 위자드라이버와 위자드 링과 위자소드건과 머신윙거와 긴가 스파크와 울트라맨 타로의 스파크 돌즈를 받고 레드는 제97관리외세계로 가기로 했다. 포켓몬스터 SPECIAL의 주인공 레드 11세가 긴가 스파크로 차원의 문을 열고 거기로 들어가 마법소녀 리리컬 나노하의 세계로 들어와 가면라이더 위자드로 변신해서 자신의 포켓몬들(피카츄, 뇨로본, 후시기바나, 카비곤, 갸라도스, 푸테라)과 함께 쥬얼시드 사건의 뛰어들어 나노하한테 정체를 숨기면서 도와주기도 하고 거대한 괴수가 나타나면 긴가 스파크와 울트라맨 긴가의 스파크 돌즈로 울트라맨 긴가로 변신해서 맞서 싸우기도 하는 이야기!